西班牙殖民者在八连市场对面的城墙上架设大炮，随时准备镇压。
西班牙殖民者出征美洛居强迫二百五十名中国侨民当兵。
这些侨民不堪忍受殖民头目的虐待，起来反抗，杀死头目，驾船逃走。
这一事件加深了西班牙殖民者的猜忌。
万历三十年1602，有个人为了讨好奉命采金的宦官，上疏说吕宋的山上出产金豆，可以采取。
明皇帝万历下诏，由福建当局派人前去吕宋勘查。
三名使者到了吕宋，被逐回，西班牙殖民者由此更怀疑中国想夺取吕宋，便精心策划，在第二年九月发起了对明朝侨民的大屠杀，死者二万五千人。
大屠杀以后，马尼拉的明人所剩无几，社会生活的各个方面都发生困难，中国商船停止前往。
西班牙殖民当局为了自身的利益，又设法鼓励中国人移居。
崇祯十二年1639，中国侨民又增至二万八千人。
殖民者再次感到恐惧，将许多中国人遣送到各地修道士庄园中作劳工，并且加重了捐税。
中国侨民难以忍受殖民者的压迫，纷纷起来反抗，但被早有准备的殖民当局用残酷的手段镇压了下去，死亡达两万多人。
明朝政府以及崇祯对于西班牙殖民者的暴行，没有采取任何有力的保护措施。
一方面因为国内社会矛盾尖锐，无暇顾及，自身都难保，如何能对付海外？
另一方面则因为明朝政府一贯把不归的行为视为触犯大明刑律。
这些长期侨居国外的百姓在当政者看来都是“奸民”，你们死了活该，当然不会加以保护。
实际上，正是明朝政府这种态度助长了西班牙殖民者的嚣张气焰，毕竟连官府都不管他们，杀就杀了。
而西班牙也算是政府支持的殖民行动。